Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SpopQ6ZWS8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SpopQ6ZWS8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SpopQ6ZWS8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SpopQ6ZWS8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SpopQ6ZWS8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SpopQ6ZWS8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SpopQ6ZWS8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SpopQ6ZWS8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SpopQ6ZWS8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SpopQ6ZWS8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SpopQ6ZWS8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SpopQ6ZWS8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SpopQ6ZWS8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SpopQ6ZWS8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SpopQ6ZWS8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SpopQ6ZWS8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SpopQ6ZWS8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SpopQ6ZWS8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SpopQ6ZWS8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SpopQ6ZWS8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SpopQ6ZWS8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SpopQ6ZWS8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SpopQ6ZWS8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SpopQ6ZWS8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SpopQ6ZWS8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SpopQ6ZWS8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SpopQ6ZWS8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SpopQ6ZWS8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SpopQ6ZWS8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SpopQ6ZWS8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SpopQ6ZWS8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SpopQ6ZWS8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SpopQ6ZWS8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SpopQ6ZWS8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SpopQ6ZWS8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SpopQ6ZWS8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SpopQ6ZWS8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SpopQ6ZWS8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SpopQ6ZWS8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SpopQ6ZWS8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SpopQ6ZWS8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SpopQ6ZWS8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SpopQ6ZWS8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SpopQ6ZWS8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SpopQ6ZWS8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SpopQ6ZWS8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SpopQ6ZWS8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SpopQ6ZWS8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SpopQ6ZWS8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SpopQ6ZWS8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SpopQ6ZWS8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SpopQ6ZWS8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SpopQ6ZWS8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SpopQ6ZWS8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SpopQ6ZWS8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SpopQ6ZWS8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SpopQ6ZWS8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SpopQ6ZWS8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SpopQ6ZWS8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SpopQ6ZWS8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SpopQ6ZWS8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SpopQ6ZWS8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SpopQ6ZWS8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SpopQ6ZWS8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SpopQ6ZWS8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SpopQ6ZWS8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SpopQ6ZWS8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SpopQ6ZWS8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SpopQ6ZWS8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SpopQ6ZWS8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SpopQ6ZWS8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SpopQ6ZWS8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SpopQ6ZWS8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SpopQ6ZWS8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SpopQ6ZWS8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SpopQ6ZWS8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SpopQ6ZWS8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SpopQ6ZWS8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SpopQ6ZWS8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SpopQ6ZWS8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SpopQ6ZWS8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SpopQ6ZWS8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SpopQ6ZWS8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SpopQ6ZWS8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SpopQ6ZWS8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SpopQ6ZWS8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms