Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Topbp1Q6ZQF0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Topbp1Q6ZQF0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Topbp1Q6ZQF0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Topbp1Q6ZQF0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Topbp1Q6ZQF0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Topbp1Q6ZQF0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Topbp1Q6ZQF0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Topbp1Q6ZQF0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Topbp1Q6ZQF0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Topbp1Q6ZQF0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Topbp1Q6ZQF0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Topbp1Q6ZQF0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Topbp1Q6ZQF0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Topbp1Q6ZQF0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Topbp1Q6ZQF0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Topbp1Q6ZQF0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Topbp1Q6ZQF0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Topbp1Q6ZQF0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Topbp1Q6ZQF0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Topbp1Q6ZQF0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Topbp1Q6ZQF0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Topbp1Q6ZQF0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Topbp1Q6ZQF0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Topbp1Q6ZQF0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Topbp1Q6ZQF0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Topbp1Q6ZQF0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Topbp1Q6ZQF0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Topbp1Q6ZQF0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Topbp1Q6ZQF0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Topbp1Q6ZQF0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Topbp1Q6ZQF0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Topbp1Q6ZQF0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Topbp1Q6ZQF0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Topbp1Q6ZQF0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Topbp1Q6ZQF0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Topbp1Q6ZQF0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Topbp1Q6ZQF0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Topbp1Q6ZQF0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Topbp1Q6ZQF0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Topbp1Q6ZQF0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Topbp1Q6ZQF0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Topbp1Q6ZQF0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Topbp1Q6ZQF0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Topbp1Q6ZQF0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Topbp1Q6ZQF0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Topbp1Q6ZQF0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Topbp1Q6ZQF0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Topbp1Q6ZQF0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Topbp1Q6ZQF0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Topbp1Q6ZQF0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Topbp1Q6ZQF0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Topbp1Q6ZQF0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Topbp1Q6ZQF0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Topbp1Q6ZQF0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Topbp1Q6ZQF0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Topbp1Q6ZQF0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Topbp1Q6ZQF0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Topbp1Q6ZQF0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Topbp1Q6ZQF0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Topbp1Q6ZQF0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Topbp1Q6ZQF0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Topbp1Q6ZQF0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Topbp1Q6ZQF0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Topbp1Q6ZQF0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Topbp1Q6ZQF0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Topbp1Q6ZQF0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Topbp1Q6ZQF0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Topbp1Q6ZQF0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Topbp1Q6ZQF0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Topbp1Q6ZQF0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Topbp1Q6ZQF0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Topbp1Q6ZQF0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Topbp1Q6ZQF0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Topbp1Q6ZQF0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Topbp1Q6ZQF0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Topbp1Q6ZQF0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Topbp1Q6ZQF0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Topbp1Q6ZQF0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Topbp1Q6ZQF0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Topbp1Q6ZQF0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Topbp1Q6ZQF0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Topbp1Q6ZQF0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Topbp1Q6ZQF0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Topbp1Q6ZQF0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Topbp1Q6ZQF0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Topbp1Q6ZQF0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Topbp1Q6ZQF0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Topbp1Q6ZQF0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Topbp1Q6ZQF0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Topbp1Q6ZQF0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Topbp1Q6ZQF0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Topbp1Q6ZQF0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Topbp1Q6ZQF0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Topbp1Q6ZQF0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Topbp1Q6ZQF0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Topbp1Q6ZQF0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms