Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnot1Q6ZQ08 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnot1Q6ZQ08 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot1Q6ZQ08 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot1Q6ZQ08 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot1Q6ZQ08 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot1Q6ZQ08 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot1Q6ZQ08 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot1Q6ZQ08 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot1Q6ZQ08 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot1Q6ZQ08 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot1Q6ZQ08 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot1Q6ZQ08 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot1Q6ZQ08 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot1Q6ZQ08 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot1Q6ZQ08 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot1Q6ZQ08 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot1Q6ZQ08 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot1Q6ZQ08 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot1Q6ZQ08 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot1Q6ZQ08 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot1Q6ZQ08 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot1Q6ZQ08 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot1Q6ZQ08 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot1Q6ZQ08 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnot1Q6ZQ08 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnot1Q6ZQ08 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnot1Q6ZQ08 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot1Q6ZQ08 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot1Q6ZQ08 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot1Q6ZQ08 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot1Q6ZQ08 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnot1Q6ZQ08 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnot1Q6ZQ08 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnot1Q6ZQ08 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnot1Q6ZQ08 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnot1Q6ZQ08 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnot1Q6ZQ08 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnot1Q6ZQ08 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnot1Q6ZQ08 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnot1Q6ZQ08 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnot1Q6ZQ08 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnot1Q6ZQ08 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot1Q6ZQ08 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot1Q6ZQ08 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot1Q6ZQ08 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot1Q6ZQ08 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cnot1Q6ZQ08 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnot1Q6ZQ08 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnot1Q6ZQ08 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnot1Q6ZQ08 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnot1Q6ZQ08 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnot1Q6ZQ08 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnot1Q6ZQ08 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnot1Q6ZQ08 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnot1Q6ZQ08 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnot1Q6ZQ08 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnot1Q6ZQ08 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnot1Q6ZQ08 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnot1Q6ZQ08 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnot1Q6ZQ08 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot1Q6ZQ08 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot1Q6ZQ08 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot1Q6ZQ08 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot1Q6ZQ08 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnot1Q6ZQ08 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnot1Q6ZQ08 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnot1Q6ZQ08 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnot1Q6ZQ08 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnot1Q6ZQ08 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnot1Q6ZQ08 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnot1Q6ZQ08 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnot1Q6ZQ08 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnot1Q6ZQ08 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnot1Q6ZQ08 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnot1Q6ZQ08 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnot1Q6ZQ08 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnot1Q6ZQ08 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnot1Q6ZQ08 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnot1Q6ZQ08 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnot1Q6ZQ08 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnot1Q6ZQ08 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnot1Q6ZQ08 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnot1Q6ZQ08 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnot1Q6ZQ08 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms