Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Glis3Q6XP49 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Glis3Q6XP49 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Glis3Q6XP49 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Glis3Q6XP49 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Glis3Q6XP49 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Glis3Q6XP49 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Glis3Q6XP49 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Glis3Q6XP49 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Glis3Q6XP49 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Glis3Q6XP49 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Glis3Q6XP49 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Glis3Q6XP49 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Glis3Q6XP49 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Glis3Q6XP49 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Glis3Q6XP49 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Glis3Q6XP49 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27,66■■■□□ 2,02
Glis3Q6XP49 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Glis3Q6XP49 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Glis3Q6XP49 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Glis3Q6XP49 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Glis3Q6XP49 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Glis3Q6XP49 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27,64■■■□□ 2,02
Glis3Q6XP49 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Glis3Q6XP49 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Glis3Q6XP49 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Glis3Q6XP49 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Glis3Q6XP49 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Glis3Q6XP49 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Glis3Q6XP49 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Glis3Q6XP49 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Glis3Q6XP49 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Glis3Q6XP49 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Glis3Q6XP49 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27,62■■■□□ 2,01
Glis3Q6XP49 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27,62■■■□□ 2,01
Glis3Q6XP49 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Glis3Q6XP49 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Glis3Q6XP49 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Glis3Q6XP49 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Glis3Q6XP49 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Glis3Q6XP49 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Glis3Q6XP49 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Glis3Q6XP49 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Glis3Q6XP49 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Glis3Q6XP49 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Glis3Q6XP49 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Glis3Q6XP49 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Glis3Q6XP49 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Glis3Q6XP49 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Glis3Q6XP49 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Glis3Q6XP49 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27,57■■■□□ 2
Glis3Q6XP49 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27,56■■■□□ 2
Glis3Q6XP49 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27,56■■■□□ 2
Glis3Q6XP49 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27,55■■■□□ 2
Glis3Q6XP49 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27,55■■■□□ 2
Glis3Q6XP49 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Glis3Q6XP49 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Glis3Q6XP49 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Glis3Q6XP49 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Glis3Q6XP49 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Glis3Q6XP49 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27,54■■■□□ 2
Glis3Q6XP49 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27,54■■■□□ 2
Glis3Q6XP49 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Glis3Q6XP49 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27,53■■■□□ 2
Glis3Q6XP49 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27,53■■■□□ 2
Glis3Q6XP49 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Glis3Q6XP49 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Glis3Q6XP49 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Glis3Q6XP49 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Glis3Q6XP49 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Glis3Q6XP49 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Glis3Q6XP49 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Glis3Q6XP49 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Glis3Q6XP49 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27,51■■□□□ 1,99
Glis3Q6XP49 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Glis3Q6XP49 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Glis3Q6XP49 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Glis3Q6XP49 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Glis3Q6XP49 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Glis3Q6XP49 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Glis3Q6XP49 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Glis3Q6XP49 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Glis3Q6XP49 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,98
Glis3Q6XP49 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,98
Glis3Q6XP49 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Glis3Q6XP49 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Glis3Q6XP49 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Glis3Q6XP49 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27,43■■□□□ 1,98
Glis3Q6XP49 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Glis3Q6XP49 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Glis3Q6XP49 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Glis3Q6XP49 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Glis3Q6XP49 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Glis3Q6XP49 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,42■■□□□ 1,98
Glis3Q6XP49 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27,42■■□□□ 1,98
Glis3Q6XP49 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Glis3Q6XP49 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27,41■■□□□ 1,98
Glis3Q6XP49 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Glis3Q6XP49 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27,4■■□□□ 1,98
Glis3Q6XP49 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms