Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcp4l1Q6W8Q3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcp4l1Q6W8Q3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcp4l1Q6W8Q3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcp4l1Q6W8Q3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcp4l1Q6W8Q3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcp4l1Q6W8Q3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcp4l1Q6W8Q3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcp4l1Q6W8Q3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcp4l1Q6W8Q3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pcp4l1Q6W8Q3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pcp4l1Q6W8Q3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcp4l1Q6W8Q3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcp4l1Q6W8Q3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcp4l1Q6W8Q3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcp4l1Q6W8Q3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pcp4l1Q6W8Q3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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