Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY53

AY358078, HN1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY358078Q6UY53 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AY358078Q6UY53 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AY358078Q6UY53 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AY358078Q6UY53 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AY358078Q6UY53 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AY358078Q6UY53 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
AY358078Q6UY53 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AY358078Q6UY53 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AY358078Q6UY53 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AY358078Q6UY53 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AY358078Q6UY53 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AY358078Q6UY53 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AY358078Q6UY53 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AY358078Q6UY53 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AY358078Q6UY53 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
AY358078Q6UY53 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
AY358078Q6UY53 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
AY358078Q6UY53 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AY358078Q6UY53 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AY358078Q6UY53 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AY358078Q6UY53 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AY358078Q6UY53 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AY358078Q6UY53 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AY358078Q6UY53 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AY358078Q6UY53 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AY358078Q6UY53 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
AY358078Q6UY53 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AY358078Q6UY53 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AY358078Q6UY53 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AY358078Q6UY53 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AY358078Q6UY53 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AY358078Q6UY53 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AY358078Q6UY53 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AY358078Q6UY53 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AY358078Q6UY53 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AY358078Q6UY53 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AY358078Q6UY53 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AY358078Q6UY53 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AY358078Q6UY53 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms