Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY52

Gm7247, Predicted gene 7247, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7247Q6UY52 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm7247Q6UY52 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm7247Q6UY52 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm7247Q6UY52 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm7247Q6UY52 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm7247Q6UY52 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm7247Q6UY52 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm7247Q6UY52 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm7247Q6UY52 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm7247Q6UY52 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm7247Q6UY52 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm7247Q6UY52 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm7247Q6UY52 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm7247Q6UY52 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm7247Q6UY52 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm7247Q6UY52 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm7247Q6UY52 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm7247Q6UY52 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm7247Q6UY52 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm7247Q6UY52 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm7247Q6UY52 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm7247Q6UY52 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm7247Q6UY52 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm7247Q6UY52 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm7247Q6UY52 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm7247Q6UY52 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm7247Q6UY52 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm7247Q6UY52 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm7247Q6UY52 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm7247Q6UY52 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm7247Q6UY52 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm7247Q6UY52 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm7247Q6UY52 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm7247Q6UY52 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm7247Q6UY52 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm7247Q6UY52 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm7247Q6UY52 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm7247Q6UY52 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm7247Q6UY52 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm7247Q6UY52 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm7247Q6UY52 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm7247Q6UY52 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm7247Q6UY52 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm7247Q6UY52 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm7247Q6UY52 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm7247Q6UY52 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm7247Q6UY52 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm7247Q6UY52 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm7247Q6UY52 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm7247Q6UY52 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm7247Q6UY52 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm7247Q6UY52 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm7247Q6UY52 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm7247Q6UY52 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm7247Q6UY52 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm7247Q6UY52 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm7247Q6UY52 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm7247Q6UY52 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm7247Q6UY52 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm7247Q6UY52 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm7247Q6UY52 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm7247Q6UY52 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm7247Q6UY52 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm7247Q6UY52 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm7247Q6UY52 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm7247Q6UY52 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm7247Q6UY52 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm7247Q6UY52 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm7247Q6UY52 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms