Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Atp8b3Q6UQ17 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Atp8b3Q6UQ17 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Atp8b3Q6UQ17 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp8b3Q6UQ17 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atp8b3Q6UQ17 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp8b3Q6UQ17 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp8b3Q6UQ17 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp8b3Q6UQ17 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp8b3Q6UQ17 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp8b3Q6UQ17 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp8b3Q6UQ17 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp8b3Q6UQ17 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp8b3Q6UQ17 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp8b3Q6UQ17 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp8b3Q6UQ17 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp8b3Q6UQ17 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp8b3Q6UQ17 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp8b3Q6UQ17 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atp8b3Q6UQ17 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atp8b3Q6UQ17 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atp8b3Q6UQ17 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp8b3Q6UQ17 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp8b3Q6UQ17 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp8b3Q6UQ17 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp8b3Q6UQ17 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp8b3Q6UQ17 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp8b3Q6UQ17 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp8b3Q6UQ17 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp8b3Q6UQ17 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp8b3Q6UQ17 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp8b3Q6UQ17 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp8b3Q6UQ17 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp8b3Q6UQ17 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp8b3Q6UQ17 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp8b3Q6UQ17 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp8b3Q6UQ17 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp8b3Q6UQ17 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp8b3Q6UQ17 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp8b3Q6UQ17 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp8b3Q6UQ17 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp8b3Q6UQ17 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp8b3Q6UQ17 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp8b3Q6UQ17 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp8b3Q6UQ17 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp8b3Q6UQ17 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp8b3Q6UQ17 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp8b3Q6UQ17 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp8b3Q6UQ17 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp8b3Q6UQ17 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp8b3Q6UQ17 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp8b3Q6UQ17 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp8b3Q6UQ17 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp8b3Q6UQ17 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp8b3Q6UQ17 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp8b3Q6UQ17 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp8b3Q6UQ17 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp8b3Q6UQ17 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp8b3Q6UQ17 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp8b3Q6UQ17 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp8b3Q6UQ17 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp8b3Q6UQ17 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp8b3Q6UQ17 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp8b3Q6UQ17 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp8b3Q6UQ17 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms