Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDP3

Klhl17, Kelch-like protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl17Q6TDP3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl17Q6TDP3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl17Q6TDP3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klhl17Q6TDP3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klhl17Q6TDP3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klhl17Q6TDP3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klhl17Q6TDP3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klhl17Q6TDP3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klhl17Q6TDP3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klhl17Q6TDP3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klhl17Q6TDP3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl17Q6TDP3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl17Q6TDP3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl17Q6TDP3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl17Q6TDP3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl17Q6TDP3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhl17Q6TDP3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhl17Q6TDP3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhl17Q6TDP3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klhl17Q6TDP3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klhl17Q6TDP3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klhl17Q6TDP3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klhl17Q6TDP3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl17Q6TDP3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl17Q6TDP3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl17Q6TDP3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl17Q6TDP3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl17Q6TDP3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl17Q6TDP3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl17Q6TDP3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhl17Q6TDP3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhl17Q6TDP3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhl17Q6TDP3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhl17Q6TDP3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhl17Q6TDP3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl17Q6TDP3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl17Q6TDP3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl17Q6TDP3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl17Q6TDP3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl17Q6TDP3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl17Q6TDP3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl17Q6TDP3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhl17Q6TDP3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhl17Q6TDP3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhl17Q6TDP3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhl17Q6TDP3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhl17Q6TDP3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhl17Q6TDP3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhl17Q6TDP3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhl17Q6TDP3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhl17Q6TDP3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhl17Q6TDP3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhl17Q6TDP3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhl17Q6TDP3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhl17Q6TDP3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhl17Q6TDP3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhl17Q6TDP3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Klhl17Q6TDP3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhl17Q6TDP3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klhl17Q6TDP3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klhl17Q6TDP3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klhl17Q6TDP3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klhl17Q6TDP3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhl17Q6TDP3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms