Protein–RNA interactions for Protein: Q6T3U4

Npc1l1, Niemann-Pick C1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1l1Q6T3U4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Npc1l1Q6T3U4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Npc1l1Q6T3U4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Npc1l1Q6T3U4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Npc1l1Q6T3U4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Npc1l1Q6T3U4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Npc1l1Q6T3U4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Npc1l1Q6T3U4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Npc1l1Q6T3U4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Npc1l1Q6T3U4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Npc1l1Q6T3U4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Npc1l1Q6T3U4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Npc1l1Q6T3U4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Npc1l1Q6T3U4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Npc1l1Q6T3U4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Npc1l1Q6T3U4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Npc1l1Q6T3U4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Npc1l1Q6T3U4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Npc1l1Q6T3U4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Npc1l1Q6T3U4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Npc1l1Q6T3U4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Npc1l1Q6T3U4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Npc1l1Q6T3U4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Npc1l1Q6T3U4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Npc1l1Q6T3U4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Npc1l1Q6T3U4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Npc1l1Q6T3U4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Npc1l1Q6T3U4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Npc1l1Q6T3U4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Npc1l1Q6T3U4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Npc1l1Q6T3U4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Npc1l1Q6T3U4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Npc1l1Q6T3U4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Npc1l1Q6T3U4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Npc1l1Q6T3U4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Npc1l1Q6T3U4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Npc1l1Q6T3U4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Npc1l1Q6T3U4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Npc1l1Q6T3U4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Npc1l1Q6T3U4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Npc1l1Q6T3U4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Npc1l1Q6T3U4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Npc1l1Q6T3U4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Npc1l1Q6T3U4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Npc1l1Q6T3U4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Npc1l1Q6T3U4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Npc1l1Q6T3U4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Npc1l1Q6T3U4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Npc1l1Q6T3U4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Npc1l1Q6T3U4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Npc1l1Q6T3U4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Npc1l1Q6T3U4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Npc1l1Q6T3U4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Npc1l1Q6T3U4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Npc1l1Q6T3U4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Npc1l1Q6T3U4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Npc1l1Q6T3U4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Npc1l1Q6T3U4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Npc1l1Q6T3U4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Npc1l1Q6T3U4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Npc1l1Q6T3U4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Npc1l1Q6T3U4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Npc1l1Q6T3U4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Npc1l1Q6T3U4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Npc1l1Q6T3U4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Npc1l1Q6T3U4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms