Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shc4Q6S5L9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shc4Q6S5L9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shc4Q6S5L9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Shc4Q6S5L9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shc4Q6S5L9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shc4Q6S5L9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Shc4Q6S5L9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shc4Q6S5L9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shc4Q6S5L9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shc4Q6S5L9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shc4Q6S5L9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shc4Q6S5L9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Shc4Q6S5L9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shc4Q6S5L9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shc4Q6S5L9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shc4Q6S5L9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shc4Q6S5L9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shc4Q6S5L9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shc4Q6S5L9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shc4Q6S5L9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Shc4Q6S5L9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shc4Q6S5L9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shc4Q6S5L9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shc4Q6S5L9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shc4Q6S5L9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shc4Q6S5L9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Shc4Q6S5L9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shc4Q6S5L9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shc4Q6S5L9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shc4Q6S5L9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shc4Q6S5L9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shc4Q6S5L9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Shc4Q6S5L9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shc4Q6S5L9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Shc4Q6S5L9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shc4Q6S5L9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shc4Q6S5L9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shc4Q6S5L9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Shc4Q6S5L9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shc4Q6S5L9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shc4Q6S5L9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shc4Q6S5L9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shc4Q6S5L9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shc4Q6S5L9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shc4Q6S5L9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shc4Q6S5L9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shc4Q6S5L9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shc4Q6S5L9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shc4Q6S5L9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shc4Q6S5L9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shc4Q6S5L9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shc4Q6S5L9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shc4Q6S5L9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shc4Q6S5L9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shc4Q6S5L9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shc4Q6S5L9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shc4Q6S5L9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shc4Q6S5L9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shc4Q6S5L9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shc4Q6S5L9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shc4Q6S5L9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shc4Q6S5L9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms