Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc154Q6RUT8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc154Q6RUT8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc154Q6RUT8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc154Q6RUT8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc154Q6RUT8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc154Q6RUT8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc154Q6RUT8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc154Q6RUT8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc154Q6RUT8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc154Q6RUT8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc154Q6RUT8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc154Q6RUT8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc154Q6RUT8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc154Q6RUT8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc154Q6RUT8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc154Q6RUT8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc154Q6RUT8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc154Q6RUT8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc154Q6RUT8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc154Q6RUT8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc154Q6RUT8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc154Q6RUT8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc154Q6RUT8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc154Q6RUT8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc154Q6RUT8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc154Q6RUT8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc154Q6RUT8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc154Q6RUT8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc154Q6RUT8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc154Q6RUT8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc154Q6RUT8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc154Q6RUT8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc154Q6RUT8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc154Q6RUT8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc154Q6RUT8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms