Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GcsamQ6RFH4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GcsamQ6RFH4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GcsamQ6RFH4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GcsamQ6RFH4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GcsamQ6RFH4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GcsamQ6RFH4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GcsamQ6RFH4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GcsamQ6RFH4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GcsamQ6RFH4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GcsamQ6RFH4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GcsamQ6RFH4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GcsamQ6RFH4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GcsamQ6RFH4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GcsamQ6RFH4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GcsamQ6RFH4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GcsamQ6RFH4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GcsamQ6RFH4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GcsamQ6RFH4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GcsamQ6RFH4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GcsamQ6RFH4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GcsamQ6RFH4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GcsamQ6RFH4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GcsamQ6RFH4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GcsamQ6RFH4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GcsamQ6RFH4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GcsamQ6RFH4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GcsamQ6RFH4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GcsamQ6RFH4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GcsamQ6RFH4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GcsamQ6RFH4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GcsamQ6RFH4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GcsamQ6RFH4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GcsamQ6RFH4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GcsamQ6RFH4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GcsamQ6RFH4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GcsamQ6RFH4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GcsamQ6RFH4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GcsamQ6RFH4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GcsamQ6RFH4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms