Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmeff1Q6PFE7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmeff1Q6PFE7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmeff1Q6PFE7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmeff1Q6PFE7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmeff1Q6PFE7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmeff1Q6PFE7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmeff1Q6PFE7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmeff1Q6PFE7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmeff1Q6PFE7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmeff1Q6PFE7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmeff1Q6PFE7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmeff1Q6PFE7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmeff1Q6PFE7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmeff1Q6PFE7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmeff1Q6PFE7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmeff1Q6PFE7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmeff1Q6PFE7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmeff1Q6PFE7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmeff1Q6PFE7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmeff1Q6PFE7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmeff1Q6PFE7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmeff1Q6PFE7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmeff1Q6PFE7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmeff1Q6PFE7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmeff1Q6PFE7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmeff1Q6PFE7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmeff1Q6PFE7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmeff1Q6PFE7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmeff1Q6PFE7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmeff1Q6PFE7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmeff1Q6PFE7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmeff1Q6PFE7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmeff1Q6PFE7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmeff1Q6PFE7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmeff1Q6PFE7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmeff1Q6PFE7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmeff1Q6PFE7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmeff1Q6PFE7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmeff1Q6PFE7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmeff1Q6PFE7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmeff1Q6PFE7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmeff1Q6PFE7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmeff1Q6PFE7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmeff1Q6PFE7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmeff1Q6PFE7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmeff1Q6PFE7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmeff1Q6PFE7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmeff1Q6PFE7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmeff1Q6PFE7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmeff1Q6PFE7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmeff1Q6PFE7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmeff1Q6PFE7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmeff1Q6PFE7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmeff1Q6PFE7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmeff1Q6PFE7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmeff1Q6PFE7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmeff1Q6PFE7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmeff1Q6PFE7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmeff1Q6PFE7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmeff1Q6PFE7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmeff1Q6PFE7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmeff1Q6PFE7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmeff1Q6PFE7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmeff1Q6PFE7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmeff1Q6PFE7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmeff1Q6PFE7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmeff1Q6PFE7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmeff1Q6PFE7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmeff1Q6PFE7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmeff1Q6PFE7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmeff1Q6PFE7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmeff1Q6PFE7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmeff1Q6PFE7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmeff1Q6PFE7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmeff1Q6PFE7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmeff1Q6PFE7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmeff1Q6PFE7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmeff1Q6PFE7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmeff1Q6PFE7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmeff1Q6PFE7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmeff1Q6PFE7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmeff1Q6PFE7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmeff1Q6PFE7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmeff1Q6PFE7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmeff1Q6PFE7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmeff1Q6PFE7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmeff1Q6PFE7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmeff1Q6PFE7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmeff1Q6PFE7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmeff1Q6PFE7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmeff1Q6PFE7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmeff1Q6PFE7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmeff1Q6PFE7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmeff1Q6PFE7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmeff1Q6PFE7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmeff1Q6PFE7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmeff1Q6PFE7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms