Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad54bQ6PFE3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad54bQ6PFE3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad54bQ6PFE3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad54bQ6PFE3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad54bQ6PFE3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad54bQ6PFE3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad54bQ6PFE3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad54bQ6PFE3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rad54bQ6PFE3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rad54bQ6PFE3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rad54bQ6PFE3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rad54bQ6PFE3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rad54bQ6PFE3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad54bQ6PFE3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad54bQ6PFE3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad54bQ6PFE3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad54bQ6PFE3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad54bQ6PFE3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rad54bQ6PFE3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rad54bQ6PFE3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rad54bQ6PFE3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rad54bQ6PFE3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rad54bQ6PFE3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rad54bQ6PFE3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rad54bQ6PFE3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rad54bQ6PFE3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad54bQ6PFE3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad54bQ6PFE3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad54bQ6PFE3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad54bQ6PFE3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad54bQ6PFE3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad54bQ6PFE3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad54bQ6PFE3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad54bQ6PFE3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad54bQ6PFE3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad54bQ6PFE3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad54bQ6PFE3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad54bQ6PFE3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad54bQ6PFE3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad54bQ6PFE3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad54bQ6PFE3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad54bQ6PFE3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad54bQ6PFE3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad54bQ6PFE3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rad54bQ6PFE3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad54bQ6PFE3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad54bQ6PFE3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad54bQ6PFE3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad54bQ6PFE3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad54bQ6PFE3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad54bQ6PFE3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad54bQ6PFE3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad54bQ6PFE3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad54bQ6PFE3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad54bQ6PFE3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad54bQ6PFE3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad54bQ6PFE3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad54bQ6PFE3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad54bQ6PFE3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad54bQ6PFE3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad54bQ6PFE3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad54bQ6PFE3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad54bQ6PFE3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad54bQ6PFE3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad54bQ6PFE3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad54bQ6PFE3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad54bQ6PFE3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rad54bQ6PFE3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rad54bQ6PFE3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rad54bQ6PFE3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad54bQ6PFE3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad54bQ6PFE3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad54bQ6PFE3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad54bQ6PFE3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad54bQ6PFE3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad54bQ6PFE3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad54bQ6PFE3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad54bQ6PFE3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad54bQ6PFE3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad54bQ6PFE3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad54bQ6PFE3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad54bQ6PFE3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad54bQ6PFE3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad54bQ6PFE3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad54bQ6PFE3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad54bQ6PFE3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad54bQ6PFE3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad54bQ6PFE3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad54bQ6PFE3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad54bQ6PFE3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad54bQ6PFE3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad54bQ6PFE3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad54bQ6PFE3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad54bQ6PFE3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad54bQ6PFE3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad54bQ6PFE3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad54bQ6PFE3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad54bQ6PFE3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad54bQ6PFE3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms