Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gga2Q6P5E6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gga2Q6P5E6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gga2Q6P5E6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gga2Q6P5E6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gga2Q6P5E6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gga2Q6P5E6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gga2Q6P5E6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gga2Q6P5E6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gga2Q6P5E6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gga2Q6P5E6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gga2Q6P5E6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gga2Q6P5E6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gga2Q6P5E6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gga2Q6P5E6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gga2Q6P5E6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gga2Q6P5E6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gga2Q6P5E6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gga2Q6P5E6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gga2Q6P5E6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gga2Q6P5E6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gga2Q6P5E6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gga2Q6P5E6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gga2Q6P5E6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gga2Q6P5E6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gga2Q6P5E6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gga2Q6P5E6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gga2Q6P5E6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gga2Q6P5E6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gga2Q6P5E6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gga2Q6P5E6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gga2Q6P5E6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gga2Q6P5E6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gga2Q6P5E6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gga2Q6P5E6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gga2Q6P5E6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gga2Q6P5E6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gga2Q6P5E6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gga2Q6P5E6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gga2Q6P5E6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gga2Q6P5E6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms