Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fam222bQ6P539 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam222bQ6P539 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Fam222bQ6P539 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam222bQ6P539 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam222bQ6P539 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam222bQ6P539 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam222bQ6P539 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam222bQ6P539 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam222bQ6P539 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam222bQ6P539 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam222bQ6P539 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam222bQ6P539 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam222bQ6P539 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam222bQ6P539 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam222bQ6P539 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam222bQ6P539 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam222bQ6P539 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam222bQ6P539 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam222bQ6P539 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam222bQ6P539 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam222bQ6P539 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam222bQ6P539 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam222bQ6P539 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam222bQ6P539 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam222bQ6P539 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam222bQ6P539 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms