Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fndc3bQ6NWW9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Fndc3bQ6NWW9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fndc3bQ6NWW9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fndc3bQ6NWW9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fndc3bQ6NWW9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fndc3bQ6NWW9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fndc3bQ6NWW9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fndc3bQ6NWW9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fndc3bQ6NWW9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fndc3bQ6NWW9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fndc3bQ6NWW9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fndc3bQ6NWW9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fndc3bQ6NWW9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fndc3bQ6NWW9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fndc3bQ6NWW9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Fndc3bQ6NWW9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fndc3bQ6NWW9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fndc3bQ6NWW9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fndc3bQ6NWW9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fndc3bQ6NWW9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fndc3bQ6NWW9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fndc3bQ6NWW9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fndc3bQ6NWW9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fndc3bQ6NWW9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fndc3bQ6NWW9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fndc3bQ6NWW9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fndc3bQ6NWW9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fndc3bQ6NWW9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fndc3bQ6NWW9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fndc3bQ6NWW9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Fndc3bQ6NWW9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Fndc3bQ6NWW9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fndc3bQ6NWW9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fndc3bQ6NWW9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fndc3bQ6NWW9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Fndc3bQ6NWW9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fndc3bQ6NWW9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fndc3bQ6NWW9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Fndc3bQ6NWW9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc3bQ6NWW9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc3bQ6NWW9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc3bQ6NWW9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc3bQ6NWW9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc3bQ6NWW9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc3bQ6NWW9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Fndc3bQ6NWW9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fndc3bQ6NWW9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Fndc3bQ6NWW9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fndc3bQ6NWW9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fndc3bQ6NWW9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fndc3bQ6NWW9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Fndc3bQ6NWW9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fndc3bQ6NWW9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Fndc3bQ6NWW9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fndc3bQ6NWW9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fndc3bQ6NWW9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fndc3bQ6NWW9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fndc3bQ6NWW9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fndc3bQ6NWW9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fndc3bQ6NWW9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Fndc3bQ6NWW9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fndc3bQ6NWW9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fndc3bQ6NWW9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fndc3bQ6NWW9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fndc3bQ6NWW9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fndc3bQ6NWW9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fndc3bQ6NWW9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Fndc3bQ6NWW9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fndc3bQ6NWW9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fndc3bQ6NWW9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fndc3bQ6NWW9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fndc3bQ6NWW9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fndc3bQ6NWW9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fndc3bQ6NWW9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fndc3bQ6NWW9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Fndc3bQ6NWW9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fndc3bQ6NWW9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fndc3bQ6NWW9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fndc3bQ6NWW9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fndc3bQ6NWW9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fndc3bQ6NWW9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fndc3bQ6NWW9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fndc3bQ6NWW9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fndc3bQ6NWW9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fndc3bQ6NWW9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fndc3bQ6NWW9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fndc3bQ6NWW9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Fndc3bQ6NWW9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fndc3bQ6NWW9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fndc3bQ6NWW9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fndc3bQ6NWW9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Fndc3bQ6NWW9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fndc3bQ6NWW9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fndc3bQ6NWW9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fndc3bQ6NWW9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fndc3bQ6NWW9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fndc3bQ6NWW9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fndc3bQ6NWW9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fndc3bQ6NWW9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms