Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpsf6Q6NVF9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpsf6Q6NVF9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpsf6Q6NVF9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpsf6Q6NVF9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpsf6Q6NVF9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpsf6Q6NVF9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpsf6Q6NVF9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpsf6Q6NVF9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpsf6Q6NVF9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpsf6Q6NVF9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpsf6Q6NVF9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpsf6Q6NVF9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpsf6Q6NVF9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpsf6Q6NVF9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cpsf6Q6NVF9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cpsf6Q6NVF9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cpsf6Q6NVF9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cpsf6Q6NVF9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpsf6Q6NVF9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpsf6Q6NVF9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpsf6Q6NVF9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpsf6Q6NVF9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpsf6Q6NVF9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpsf6Q6NVF9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpsf6Q6NVF9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpsf6Q6NVF9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cpsf6Q6NVF9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cpsf6Q6NVF9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpsf6Q6NVF9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpsf6Q6NVF9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpsf6Q6NVF9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpsf6Q6NVF9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpsf6Q6NVF9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpsf6Q6NVF9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpsf6Q6NVF9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpsf6Q6NVF9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpsf6Q6NVF9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpsf6Q6NVF9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpsf6Q6NVF9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpsf6Q6NVF9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpsf6Q6NVF9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpsf6Q6NVF9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpsf6Q6NVF9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpsf6Q6NVF9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpsf6Q6NVF9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpsf6Q6NVF9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpsf6Q6NVF9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpsf6Q6NVF9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpsf6Q6NVF9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpsf6Q6NVF9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpsf6Q6NVF9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpsf6Q6NVF9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpsf6Q6NVF9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpsf6Q6NVF9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpsf6Q6NVF9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpsf6Q6NVF9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpsf6Q6NVF9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpsf6Q6NVF9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpsf6Q6NVF9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpsf6Q6NVF9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpsf6Q6NVF9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpsf6Q6NVF9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpsf6Q6NVF9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpsf6Q6NVF9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpsf6Q6NVF9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpsf6Q6NVF9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpsf6Q6NVF9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpsf6Q6NVF9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpsf6Q6NVF9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpsf6Q6NVF9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpsf6Q6NVF9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpsf6Q6NVF9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpsf6Q6NVF9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpsf6Q6NVF9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpsf6Q6NVF9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpsf6Q6NVF9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpsf6Q6NVF9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpsf6Q6NVF9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpsf6Q6NVF9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpsf6Q6NVF9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms