Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE3

Spin2c, Spindlin-2C, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2cQ6NVE3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Spin2cQ6NVE3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spin2cQ6NVE3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spin2cQ6NVE3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spin2cQ6NVE3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spin2cQ6NVE3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spin2cQ6NVE3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spin2cQ6NVE3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spin2cQ6NVE3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spin2cQ6NVE3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spin2cQ6NVE3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spin2cQ6NVE3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spin2cQ6NVE3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spin2cQ6NVE3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Spin2cQ6NVE3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spin2cQ6NVE3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spin2cQ6NVE3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spin2cQ6NVE3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spin2cQ6NVE3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spin2cQ6NVE3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spin2cQ6NVE3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spin2cQ6NVE3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spin2cQ6NVE3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Spin2cQ6NVE3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spin2cQ6NVE3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spin2cQ6NVE3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spin2cQ6NVE3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spin2cQ6NVE3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spin2cQ6NVE3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spin2cQ6NVE3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spin2cQ6NVE3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Spin2cQ6NVE3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Spin2cQ6NVE3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spin2cQ6NVE3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Spin2cQ6NVE3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spin2cQ6NVE3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spin2cQ6NVE3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Spin2cQ6NVE3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Spin2cQ6NVE3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Spin2cQ6NVE3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Spin2cQ6NVE3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Spin2cQ6NVE3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Spin2cQ6NVE3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Spin2cQ6NVE3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Spin2cQ6NVE3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms