Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Krt40Q6IFX3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Krt40Q6IFX3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Krt40Q6IFX3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Krt40Q6IFX3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Krt40Q6IFX3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Krt40Q6IFX3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Krt40Q6IFX3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Krt40Q6IFX3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Krt40Q6IFX3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Krt40Q6IFX3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Krt40Q6IFX3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Krt40Q6IFX3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Krt40Q6IFX3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Krt40Q6IFX3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Krt40Q6IFX3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Krt40Q6IFX3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Krt40Q6IFX3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Krt40Q6IFX3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Krt40Q6IFX3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Krt40Q6IFX3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Krt40Q6IFX3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Krt40Q6IFX3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Krt40Q6IFX3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Krt40Q6IFX3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Krt40Q6IFX3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Krt40Q6IFX3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Krt40Q6IFX3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Krt40Q6IFX3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Krt40Q6IFX3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Krt40Q6IFX3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Krt40Q6IFX3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Krt40Q6IFX3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Krt40Q6IFX3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Krt40Q6IFX3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Krt40Q6IFX3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Krt40Q6IFX3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Krt40Q6IFX3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Krt40Q6IFX3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Krt40Q6IFX3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Krt40Q6IFX3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Krt40Q6IFX3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Krt40Q6IFX3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Krt40Q6IFX3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Krt40Q6IFX3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Krt40Q6IFX3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Krt40Q6IFX3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Krt40Q6IFX3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Krt40Q6IFX3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Krt40Q6IFX3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Krt40Q6IFX3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Krt40Q6IFX3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Krt40Q6IFX3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Krt40Q6IFX3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Krt40Q6IFX3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Krt40Q6IFX3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Krt40Q6IFX3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Krt40Q6IFX3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krt40Q6IFX3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Krt40Q6IFX3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krt40Q6IFX3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krt40Q6IFX3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krt40Q6IFX3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krt40Q6IFX3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Krt40Q6IFX3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Krt40Q6IFX3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Krt40Q6IFX3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt40Q6IFX3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt40Q6IFX3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt40Q6IFX3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Krt40Q6IFX3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Krt40Q6IFX3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Krt40Q6IFX3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Krt40Q6IFX3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Krt40Q6IFX3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Krt40Q6IFX3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Krt40Q6IFX3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Krt40Q6IFX3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Krt40Q6IFX3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Krt40Q6IFX3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Krt40Q6IFX3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Krt40Q6IFX3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Krt40Q6IFX3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Krt40Q6IFX3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Krt40Q6IFX3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Krt40Q6IFX3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Krt40Q6IFX3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Krt40Q6IFX3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt40Q6IFX3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt40Q6IFX3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt40Q6IFX3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt40Q6IFX3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt40Q6IFX3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt40Q6IFX3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt40Q6IFX3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Krt40Q6IFX3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Krt40Q6IFX3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Krt40Q6IFX3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Krt40Q6IFX3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Krt40Q6IFX3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
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