Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KdsrQ6GV12 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KdsrQ6GV12 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KdsrQ6GV12 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KdsrQ6GV12 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KdsrQ6GV12 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KdsrQ6GV12 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KdsrQ6GV12 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KdsrQ6GV12 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KdsrQ6GV12 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KdsrQ6GV12 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KdsrQ6GV12 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KdsrQ6GV12 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KdsrQ6GV12 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KdsrQ6GV12 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KdsrQ6GV12 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KdsrQ6GV12 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KdsrQ6GV12 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KdsrQ6GV12 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KdsrQ6GV12 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KdsrQ6GV12 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms