Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Nop58Q6DFW4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Nop58Q6DFW4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Nop58Q6DFW4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Nop58Q6DFW4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Nop58Q6DFW4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Nop58Q6DFW4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Nop58Q6DFW4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Nop58Q6DFW4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Nop58Q6DFW4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Nop58Q6DFW4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Nop58Q6DFW4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Nop58Q6DFW4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Nop58Q6DFW4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Nop58Q6DFW4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Nop58Q6DFW4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Nop58Q6DFW4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Nop58Q6DFW4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Nop58Q6DFW4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Nop58Q6DFW4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Nop58Q6DFW4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Nop58Q6DFW4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Nop58Q6DFW4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Nop58Q6DFW4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Nop58Q6DFW4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Nop58Q6DFW4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Nop58Q6DFW4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Nop58Q6DFW4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Nop58Q6DFW4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Nop58Q6DFW4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Nop58Q6DFW4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Nop58Q6DFW4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Nop58Q6DFW4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Nop58Q6DFW4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Nop58Q6DFW4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Nop58Q6DFW4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Nop58Q6DFW4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Nop58Q6DFW4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Nop58Q6DFW4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
Nop58Q6DFW4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Nop58Q6DFW4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Nop58Q6DFW4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Nop58Q6DFW4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Nop58Q6DFW4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Nop58Q6DFW4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Nop58Q6DFW4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Nop58Q6DFW4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Nop58Q6DFW4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Nop58Q6DFW4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Nop58Q6DFW4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Nop58Q6DFW4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Nop58Q6DFW4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Nop58Q6DFW4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Nop58Q6DFW4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Nop58Q6DFW4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Nop58Q6DFW4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Nop58Q6DFW4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Nop58Q6DFW4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Nop58Q6DFW4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Nop58Q6DFW4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Nop58Q6DFW4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Nop58Q6DFW4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Nop58Q6DFW4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Nop58Q6DFW4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Nop58Q6DFW4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Nop58Q6DFW4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Nop58Q6DFW4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Nop58Q6DFW4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Nop58Q6DFW4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Nop58Q6DFW4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Nop58Q6DFW4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Nop58Q6DFW4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Nop58Q6DFW4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Nop58Q6DFW4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Nop58Q6DFW4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Nop58Q6DFW4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Nop58Q6DFW4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Nop58Q6DFW4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Nop58Q6DFW4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Nop58Q6DFW4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Nop58Q6DFW4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Nop58Q6DFW4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Nop58Q6DFW4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Nop58Q6DFW4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Nop58Q6DFW4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Nop58Q6DFW4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Nop58Q6DFW4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Nop58Q6DFW4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Nop58Q6DFW4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Nop58Q6DFW4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Nop58Q6DFW4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Nop58Q6DFW4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Nop58Q6DFW4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Nop58Q6DFW4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nop58Q6DFW4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nop58Q6DFW4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nop58Q6DFW4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nop58Q6DFW4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Nop58Q6DFW4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Nop58Q6DFW4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms