Protein–RNA interactions for Protein: Q6A039

Tbc1d12, TBC1 domain family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d12Q6A039 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbc1d12Q6A039 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbc1d12Q6A039 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbc1d12Q6A039 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbc1d12Q6A039 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbc1d12Q6A039 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tbc1d12Q6A039 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tbc1d12Q6A039 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tbc1d12Q6A039 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tbc1d12Q6A039 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tbc1d12Q6A039 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tbc1d12Q6A039 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tbc1d12Q6A039 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tbc1d12Q6A039 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tbc1d12Q6A039 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tbc1d12Q6A039 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tbc1d12Q6A039 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tbc1d12Q6A039 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tbc1d12Q6A039 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tbc1d12Q6A039 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tbc1d12Q6A039 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tbc1d12Q6A039 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tbc1d12Q6A039 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tbc1d12Q6A039 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tbc1d12Q6A039 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tbc1d12Q6A039 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tbc1d12Q6A039 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tbc1d12Q6A039 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tbc1d12Q6A039 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tbc1d12Q6A039 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tbc1d12Q6A039 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tbc1d12Q6A039 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tbc1d12Q6A039 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tbc1d12Q6A039 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tbc1d12Q6A039 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms