Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab3ipQ68EF0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab3ipQ68EF0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab3ipQ68EF0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab3ipQ68EF0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab3ipQ68EF0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab3ipQ68EF0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab3ipQ68EF0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab3ipQ68EF0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab3ipQ68EF0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab3ipQ68EF0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab3ipQ68EF0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab3ipQ68EF0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab3ipQ68EF0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab3ipQ68EF0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab3ipQ68EF0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab3ipQ68EF0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab3ipQ68EF0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab3ipQ68EF0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab3ipQ68EF0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab3ipQ68EF0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab3ipQ68EF0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab3ipQ68EF0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab3ipQ68EF0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms