Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CilpQ66K08 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CilpQ66K08 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CilpQ66K08 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CilpQ66K08 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CilpQ66K08 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CilpQ66K08 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CilpQ66K08 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CilpQ66K08 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CilpQ66K08 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CilpQ66K08 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CilpQ66K08 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CilpQ66K08 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CilpQ66K08 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CilpQ66K08 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CilpQ66K08 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CilpQ66K08 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CilpQ66K08 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CilpQ66K08 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CilpQ66K08 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CilpQ66K08 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CilpQ66K08 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CilpQ66K08 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CilpQ66K08 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CilpQ66K08 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CilpQ66K08 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CilpQ66K08 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CilpQ66K08 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CilpQ66K08 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CilpQ66K08 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CilpQ66K08 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CilpQ66K08 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CilpQ66K08 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CilpQ66K08 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CilpQ66K08 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CilpQ66K08 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CilpQ66K08 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CilpQ66K08 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CilpQ66K08 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CilpQ66K08 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CilpQ66K08 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CilpQ66K08 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CilpQ66K08 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CilpQ66K08 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CilpQ66K08 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CilpQ66K08 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CilpQ66K08 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CilpQ66K08 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CilpQ66K08 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CilpQ66K08 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CilpQ66K08 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CilpQ66K08 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CilpQ66K08 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CilpQ66K08 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CilpQ66K08 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms