Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctnna3Q65CL1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctnna3Q65CL1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctnna3Q65CL1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctnna3Q65CL1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctnna3Q65CL1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctnna3Q65CL1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctnna3Q65CL1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctnna3Q65CL1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctnna3Q65CL1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctnna3Q65CL1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ctnna3Q65CL1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctnna3Q65CL1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctnna3Q65CL1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctnna3Q65CL1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctnna3Q65CL1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctnna3Q65CL1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctnna3Q65CL1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctnna3Q65CL1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctnna3Q65CL1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctnna3Q65CL1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctnna3Q65CL1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctnna3Q65CL1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctnna3Q65CL1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctnna3Q65CL1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ctnna3Q65CL1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ctnna3Q65CL1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ctnna3Q65CL1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ctnna3Q65CL1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctnna3Q65CL1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctnna3Q65CL1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctnna3Q65CL1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctnna3Q65CL1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ctnna3Q65CL1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctnna3Q65CL1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctnna3Q65CL1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctnna3Q65CL1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctnna3Q65CL1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctnna3Q65CL1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctnna3Q65CL1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctnna3Q65CL1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctnna3Q65CL1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctnna3Q65CL1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctnna3Q65CL1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctnna3Q65CL1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctnna3Q65CL1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctnna3Q65CL1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctnna3Q65CL1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctnna3Q65CL1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctnna3Q65CL1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctnna3Q65CL1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctnna3Q65CL1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctnna3Q65CL1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctnna3Q65CL1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctnna3Q65CL1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctnna3Q65CL1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctnna3Q65CL1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctnna3Q65CL1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctnna3Q65CL1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctnna3Q65CL1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctnna3Q65CL1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctnna3Q65CL1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctnna3Q65CL1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctnna3Q65CL1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctnna3Q65CL1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctnna3Q65CL1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctnna3Q65CL1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctnna3Q65CL1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctnna3Q65CL1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctnna3Q65CL1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctnna3Q65CL1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctnna3Q65CL1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctnna3Q65CL1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctnna3Q65CL1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctnna3Q65CL1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctnna3Q65CL1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctnna3Q65CL1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctnna3Q65CL1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctnna3Q65CL1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctnna3Q65CL1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctnna3Q65CL1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctnna3Q65CL1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctnna3Q65CL1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctnna3Q65CL1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctnna3Q65CL1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctnna3Q65CL1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctnna3Q65CL1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Ctnna3Q65CL1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctnna3Q65CL1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctnna3Q65CL1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctnna3Q65CL1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctnna3Q65CL1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctnna3Q65CL1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctnna3Q65CL1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctnna3Q65CL1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctnna3Q65CL1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctnna3Q65CL1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnna3Q65CL1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnna3Q65CL1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms