Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sdc3Q64519 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdc3Q64519 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdc3Q64519 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdc3Q64519 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sdc3Q64519 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sdc3Q64519 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sdc3Q64519 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sdc3Q64519 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sdc3Q64519 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sdc3Q64519 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sdc3Q64519 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sdc3Q64519 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sdc3Q64519 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sdc3Q64519 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sdc3Q64519 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sdc3Q64519 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sdc3Q64519 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sdc3Q64519 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sdc3Q64519 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sdc3Q64519 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sdc3Q64519 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sdc3Q64519 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sdc3Q64519 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sdc3Q64519 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sdc3Q64519 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sdc3Q64519 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sdc3Q64519 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sdc3Q64519 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sdc3Q64519 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sdc3Q64519 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sdc3Q64519 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sdc3Q64519 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sdc3Q64519 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sdc3Q64519 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sdc3Q64519 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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