Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScxQ64124 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScxQ64124 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScxQ64124 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ScxQ64124 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScxQ64124 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ScxQ64124 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScxQ64124 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScxQ64124 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScxQ64124 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScxQ64124 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScxQ64124 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScxQ64124 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScxQ64124 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScxQ64124 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScxQ64124 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScxQ64124 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScxQ64124 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScxQ64124 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScxQ64124 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScxQ64124 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScxQ64124 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms