Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defa17Q64016 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defa17Q64016 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defa17Q64016 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defa17Q64016 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defa17Q64016 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defa17Q64016 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Defa17Q64016 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Defa17Q64016 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defa17Q64016 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defa17Q64016 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defa17Q64016 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Defa17Q64016 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defa17Q64016 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Defa17Q64016 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Defa17Q64016 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Defa17Q64016 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Defa17Q64016 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Defa17Q64016 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Defa17Q64016 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Defa17Q64016 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Defa17Q64016 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Defa17Q64016 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Defa17Q64016 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Defa17Q64016 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Defa17Q64016 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Defa17Q64016 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Defa17Q64016 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Defa17Q64016 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Defa17Q64016 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Defa17Q64016 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Defa17Q64016 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Defa17Q64016 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Defa17Q64016 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Defa17Q64016 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Defa17Q64016 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Defa17Q64016 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Defa17Q64016 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Defa17Q64016 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Defa17Q64016 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Defa17Q64016 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Defa17Q64016 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Defa17Q64016 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Defa17Q64016 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Defa17Q64016 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Defa17Q64016 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Defa17Q64016 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Defa17Q64016 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Defa17Q64016 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Defa17Q64016 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Defa17Q64016 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Defa17Q64016 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Defa17Q64016 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Defa17Q64016 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Defa17Q64016 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Defa17Q64016 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Defa17Q64016 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Defa17Q64016 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Defa17Q64016 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Defa17Q64016 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Defa17Q64016 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Defa17Q64016 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Defa17Q64016 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Defa17Q64016 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Defa17Q64016 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Defa17Q64016 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms