Protein–RNA interactions for Protein: Q62417

Sorbs1, Sorbin and SH3 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs1Q62417 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sorbs1Q62417 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sorbs1Q62417 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sorbs1Q62417 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sorbs1Q62417 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sorbs1Q62417 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sorbs1Q62417 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sorbs1Q62417 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sorbs1Q62417 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sorbs1Q62417 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sorbs1Q62417 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sorbs1Q62417 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sorbs1Q62417 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sorbs1Q62417 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sorbs1Q62417 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sorbs1Q62417 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sorbs1Q62417 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sorbs1Q62417 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sorbs1Q62417 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sorbs1Q62417 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sorbs1Q62417 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sorbs1Q62417 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sorbs1Q62417 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sorbs1Q62417 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sorbs1Q62417 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sorbs1Q62417 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sorbs1Q62417 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sorbs1Q62417 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sorbs1Q62417 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sorbs1Q62417 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sorbs1Q62417 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sorbs1Q62417 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sorbs1Q62417 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sorbs1Q62417 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sorbs1Q62417 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sorbs1Q62417 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sorbs1Q62417 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sorbs1Q62417 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sorbs1Q62417 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sorbs1Q62417 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sorbs1Q62417 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sorbs1Q62417 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sorbs1Q62417 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sorbs1Q62417 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sorbs1Q62417 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sorbs1Q62417 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sorbs1Q62417 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sorbs1Q62417 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sorbs1Q62417 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sorbs1Q62417 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sorbs1Q62417 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sorbs1Q62417 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sorbs1Q62417 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sorbs1Q62417 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sorbs1Q62417 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sorbs1Q62417 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sorbs1Q62417 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sorbs1Q62417 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sorbs1Q62417 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sorbs1Q62417 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sorbs1Q62417 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sorbs1Q62417 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sorbs1Q62417 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sorbs1Q62417 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sorbs1Q62417 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sorbs1Q62417 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sorbs1Q62417 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sorbs1Q62417 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sorbs1Q62417 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sorbs1Q62417 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sorbs1Q62417 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sorbs1Q62417 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sorbs1Q62417 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sorbs1Q62417 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sorbs1Q62417 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sorbs1Q62417 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sorbs1Q62417 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sorbs1Q62417 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sorbs1Q62417 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sorbs1Q62417 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sorbs1Q62417 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sorbs1Q62417 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sorbs1Q62417 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Sorbs1Q62417 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sorbs1Q62417 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sorbs1Q62417 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sorbs1Q62417 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sorbs1Q62417 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sorbs1Q62417 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sorbs1Q62417 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sorbs1Q62417 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sorbs1Q62417 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sorbs1Q62417 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sorbs1Q62417 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sorbs1Q62417 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sorbs1Q62417 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sorbs1Q62417 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sorbs1Q62417 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sorbs1Q62417 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sorbs1Q62417 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms