Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Six2Q62232 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Six2Q62232 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Six2Q62232 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Six2Q62232 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Six2Q62232 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Six2Q62232 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Six2Q62232 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Six2Q62232 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Six2Q62232 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Six2Q62232 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Six2Q62232 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Six2Q62232 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Six2Q62232 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Six2Q62232 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Six2Q62232 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Six2Q62232 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Six2Q62232 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Six2Q62232 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Six2Q62232 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Six2Q62232 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Six2Q62232 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Six2Q62232 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Six2Q62232 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Six2Q62232 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Six2Q62232 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Six2Q62232 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Six2Q62232 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Six2Q62232 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Six2Q62232 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Six2Q62232 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Six2Q62232 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Six2Q62232 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Six2Q62232 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Six2Q62232 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Six2Q62232 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Six2Q62232 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Six2Q62232 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Six2Q62232 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Six2Q62232 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Six2Q62232 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Six2Q62232 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Six2Q62232 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Six2Q62232 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Six2Q62232 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Six2Q62232 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Six2Q62232 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Six2Q62232 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Six2Q62232 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Six2Q62232 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Six2Q62232 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Six2Q62232 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Six2Q62232 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Six2Q62232 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Six2Q62232 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Six2Q62232 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Six2Q62232 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Six2Q62232 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Six2Q62232 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Six2Q62232 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Six2Q62232 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Six2Q62232 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Six2Q62232 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Six2Q62232 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Six2Q62232 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Six2Q62232 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Six2Q62232 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Six2Q62232 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Six2Q62232 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Six2Q62232 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Six2Q62232 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Six2Q62232 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Six2Q62232 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Six2Q62232 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Six2Q62232 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Six2Q62232 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Six2Q62232 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Six2Q62232 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Six2Q62232 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Six2Q62232 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Six2Q62232 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Six2Q62232 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Six2Q62232 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Six2Q62232 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Six2Q62232 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Six2Q62232 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Six2Q62232 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Six2Q62232 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Six2Q62232 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Six2Q62232 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Six2Q62232 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Six2Q62232 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Six2Q62232 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Six2Q62232 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Six2Q62232 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Six2Q62232 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Six2Q62232 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Six2Q62232 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Six2Q62232 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Six2Q62232 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms