Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema4aQ62178 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema4aQ62178 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema4aQ62178 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema4aQ62178 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema4aQ62178 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema4aQ62178 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema4aQ62178 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema4aQ62178 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema4aQ62178 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema4aQ62178 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema4aQ62178 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema4aQ62178 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema4aQ62178 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema4aQ62178 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema4aQ62178 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema4aQ62178 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema4aQ62178 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema4aQ62178 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema4aQ62178 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema4aQ62178 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema4aQ62178 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema4aQ62178 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema4aQ62178 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema4aQ62178 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema4aQ62178 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema4aQ62178 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema4aQ62178 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema4aQ62178 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema4aQ62178 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema4aQ62178 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema4aQ62178 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema4aQ62178 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema4aQ62178 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema4aQ62178 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema4aQ62178 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema4aQ62178 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema4aQ62178 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema4aQ62178 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema4aQ62178 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema4aQ62178 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema4aQ62178 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema4aQ62178 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema4aQ62178 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema4aQ62178 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema4aQ62178 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema4aQ62178 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema4aQ62178 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema4aQ62178 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema4aQ62178 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema4aQ62178 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sema4aQ62178 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sema4aQ62178 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sema4aQ62178 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema4aQ62178 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema4aQ62178 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema4aQ62178 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms