Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aldh1a2Q62148 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aldh1a2Q62148 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aldh1a2Q62148 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aldh1a2Q62148 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aldh1a2Q62148 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aldh1a2Q62148 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Aldh1a2Q62148 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Aldh1a2Q62148 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Aldh1a2Q62148 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Aldh1a2Q62148 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Aldh1a2Q62148 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Aldh1a2Q62148 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Aldh1a2Q62148 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Aldh1a2Q62148 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aldh1a2Q62148 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aldh1a2Q62148 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aldh1a2Q62148 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aldh1a2Q62148 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Aldh1a2Q62148 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aldh1a2Q62148 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aldh1a2Q62148 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Aldh1a2Q62148 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aldh1a2Q62148 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aldh1a2Q62148 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aldh1a2Q62148 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Aldh1a2Q62148 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aldh1a2Q62148 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Aldh1a2Q62148 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Aldh1a2Q62148 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Aldh1a2Q62148 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Aldh1a2Q62148 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Aldh1a2Q62148 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Aldh1a2Q62148 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Aldh1a2Q62148 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aldh1a2Q62148 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aldh1a2Q62148 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aldh1a2Q62148 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aldh1a2Q62148 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aldh1a2Q62148 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aldh1a2Q62148 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aldh1a2Q62148 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aldh1a2Q62148 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Aldh1a2Q62148 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aldh1a2Q62148 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aldh1a2Q62148 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aldh1a2Q62148 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aldh1a2Q62148 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aldh1a2Q62148 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aldh1a2Q62148 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aldh1a2Q62148 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aldh1a2Q62148 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aldh1a2Q62148 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aldh1a2Q62148 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aldh1a2Q62148 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Aldh1a2Q62148 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Aldh1a2Q62148 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Aldh1a2Q62148 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Aldh1a2Q62148 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Aldh1a2Q62148 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Aldh1a2Q62148 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Aldh1a2Q62148 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Aldh1a2Q62148 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Aldh1a2Q62148 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Aldh1a2Q62148 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Aldh1a2Q62148 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Aldh1a2Q62148 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Aldh1a2Q62148 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Aldh1a2Q62148 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Aldh1a2Q62148 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Aldh1a2Q62148 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Aldh1a2Q62148 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Aldh1a2Q62148 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Aldh1a2Q62148 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Aldh1a2Q62148 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Aldh1a2Q62148 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Aldh1a2Q62148 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Aldh1a2Q62148 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Aldh1a2Q62148 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Aldh1a2Q62148 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Aldh1a2Q62148 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Aldh1a2Q62148 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Aldh1a2Q62148 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Aldh1a2Q62148 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Aldh1a2Q62148 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Aldh1a2Q62148 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Aldh1a2Q62148 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Aldh1a2Q62148 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Aldh1a2Q62148 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Aldh1a2Q62148 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Aldh1a2Q62148 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Aldh1a2Q62148 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Aldh1a2Q62148 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Aldh1a2Q62148 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aldh1a2Q62148 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aldh1a2Q62148 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aldh1a2Q62148 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aldh1a2Q62148 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aldh1a2Q62148 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aldh1a2Q62148 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms