Protein–RNA interactions for Protein: Q61501

E2f1, Transcription factor E2F1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f1Q61501 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
E2f1Q61501 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2f1Q61501 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2f1Q61501 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
E2f1Q61501 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2f1Q61501 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2f1Q61501 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2f1Q61501 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2f1Q61501 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2f1Q61501 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2f1Q61501 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2f1Q61501 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2f1Q61501 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2f1Q61501 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2f1Q61501 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2f1Q61501 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2f1Q61501 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2f1Q61501 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2f1Q61501 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
E2f1Q61501 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2f1Q61501 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2f1Q61501 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2f1Q61501 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2f1Q61501 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2f1Q61501 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2f1Q61501 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2f1Q61501 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2f1Q61501 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2f1Q61501 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2f1Q61501 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2f1Q61501 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2f1Q61501 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2f1Q61501 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2f1Q61501 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2f1Q61501 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2f1Q61501 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2f1Q61501 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2f1Q61501 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2f1Q61501 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2f1Q61501 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2f1Q61501 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2f1Q61501 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2f1Q61501 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2f1Q61501 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f1Q61501 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2f1Q61501 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2f1Q61501 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2f1Q61501 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2f1Q61501 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2f1Q61501 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2f1Q61501 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2f1Q61501 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2f1Q61501 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2f1Q61501 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2f1Q61501 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2f1Q61501 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2f1Q61501 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2f1Q61501 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2f1Q61501 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2f1Q61501 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms