Protein–RNA interactions for Protein: Q61458

Ccnh, Cyclin-H, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnhQ61458 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CcnhQ61458 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CcnhQ61458 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CcnhQ61458 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CcnhQ61458 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CcnhQ61458 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CcnhQ61458 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CcnhQ61458 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CcnhQ61458 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CcnhQ61458 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CcnhQ61458 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CcnhQ61458 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CcnhQ61458 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CcnhQ61458 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CcnhQ61458 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CcnhQ61458 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CcnhQ61458 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CcnhQ61458 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CcnhQ61458 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CcnhQ61458 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CcnhQ61458 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CcnhQ61458 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CcnhQ61458 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CcnhQ61458 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CcnhQ61458 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CcnhQ61458 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CcnhQ61458 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CcnhQ61458 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CcnhQ61458 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CcnhQ61458 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CcnhQ61458 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CcnhQ61458 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CcnhQ61458 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CcnhQ61458 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CcnhQ61458 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CcnhQ61458 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CcnhQ61458 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CcnhQ61458 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CcnhQ61458 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CcnhQ61458 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms