Protein–RNA interactions for Protein: Q61327

Slc6a3, Sodium-dependent dopamine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a3Q61327 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a3Q61327 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a3Q61327 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a3Q61327 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc6a3Q61327 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc6a3Q61327 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc6a3Q61327 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a3Q61327 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a3Q61327 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a3Q61327 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a3Q61327 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a3Q61327 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a3Q61327 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a3Q61327 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a3Q61327 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a3Q61327 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a3Q61327 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a3Q61327 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a3Q61327 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a3Q61327 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc6a3Q61327 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc6a3Q61327 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Slc6a3Q61327 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc6a3Q61327 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc6a3Q61327 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc6a3Q61327 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc6a3Q61327 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc6a3Q61327 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc6a3Q61327 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc6a3Q61327 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc6a3Q61327 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc6a3Q61327 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms