Protein–RNA interactions for Protein: Q61233

Lcp1, Plastin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcp1Q61233 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lcp1Q61233 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lcp1Q61233 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lcp1Q61233 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lcp1Q61233 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Lcp1Q61233 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lcp1Q61233 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lcp1Q61233 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lcp1Q61233 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lcp1Q61233 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lcp1Q61233 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lcp1Q61233 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lcp1Q61233 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lcp1Q61233 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lcp1Q61233 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Lcp1Q61233 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lcp1Q61233 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lcp1Q61233 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lcp1Q61233 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Lcp1Q61233 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lcp1Q61233 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lcp1Q61233 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lcp1Q61233 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lcp1Q61233 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lcp1Q61233 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lcp1Q61233 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lcp1Q61233 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lcp1Q61233 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lcp1Q61233 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lcp1Q61233 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lcp1Q61233 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lcp1Q61233 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lcp1Q61233 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lcp1Q61233 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lcp1Q61233 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lcp1Q61233 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lcp1Q61233 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lcp1Q61233 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lcp1Q61233 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lcp1Q61233 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lcp1Q61233 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lcp1Q61233 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lcp1Q61233 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lcp1Q61233 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lcp1Q61233 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lcp1Q61233 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lcp1Q61233 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lcp1Q61233 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lcp1Q61233 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lcp1Q61233 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lcp1Q61233 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lcp1Q61233 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lcp1Q61233 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lcp1Q61233 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lcp1Q61233 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lcp1Q61233 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lcp1Q61233 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lcp1Q61233 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lcp1Q61233 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lcp1Q61233 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lcp1Q61233 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lcp1Q61233 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lcp1Q61233 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lcp1Q61233 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lcp1Q61233 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lcp1Q61233 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lcp1Q61233 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lcp1Q61233 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lcp1Q61233 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lcp1Q61233 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lcp1Q61233 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lcp1Q61233 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lcp1Q61233 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lcp1Q61233 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lcp1Q61233 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lcp1Q61233 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lcp1Q61233 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lcp1Q61233 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lcp1Q61233 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lcp1Q61233 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lcp1Q61233 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lcp1Q61233 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lcp1Q61233 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lcp1Q61233 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lcp1Q61233 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lcp1Q61233 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lcp1Q61233 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lcp1Q61233 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lcp1Q61233 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lcp1Q61233 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lcp1Q61233 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lcp1Q61233 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lcp1Q61233 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lcp1Q61233 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.4 ms