Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klf3Q60980 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Klf3Q60980 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klf3Q60980 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klf3Q60980 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klf3Q60980 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klf3Q60980 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klf3Q60980 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Klf3Q60980 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Klf3Q60980 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Klf3Q60980 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Klf3Q60980 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Klf3Q60980 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Klf3Q60980 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Klf3Q60980 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Klf3Q60980 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Klf3Q60980 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Klf3Q60980 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Klf3Q60980 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Klf3Q60980 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Klf3Q60980 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Klf3Q60980 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Klf3Q60980 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Klf3Q60980 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Klf3Q60980 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Klf3Q60980 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Klf3Q60980 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Klf3Q60980 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Klf3Q60980 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Klf3Q60980 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Klf3Q60980 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Klf3Q60980 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms