Protein–RNA interactions for Protein: Q60967

Papss1, Bifunctional 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papss1Q60967 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Papss1Q60967 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Papss1Q60967 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Papss1Q60967 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Papss1Q60967 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Papss1Q60967 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Papss1Q60967 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Papss1Q60967 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Papss1Q60967 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Papss1Q60967 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Papss1Q60967 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Papss1Q60967 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Papss1Q60967 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Papss1Q60967 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Papss1Q60967 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Papss1Q60967 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Papss1Q60967 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Papss1Q60967 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Papss1Q60967 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Papss1Q60967 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Papss1Q60967 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Papss1Q60967 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Papss1Q60967 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Papss1Q60967 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Papss1Q60967 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Papss1Q60967 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Papss1Q60967 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Papss1Q60967 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Papss1Q60967 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Papss1Q60967 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Papss1Q60967 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Papss1Q60967 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Papss1Q60967 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Papss1Q60967 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Papss1Q60967 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Papss1Q60967 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Papss1Q60967 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Papss1Q60967 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Papss1Q60967 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Papss1Q60967 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Papss1Q60967 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Papss1Q60967 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Papss1Q60967 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Papss1Q60967 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Papss1Q60967 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Papss1Q60967 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Papss1Q60967 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Papss1Q60967 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Papss1Q60967 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Papss1Q60967 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Papss1Q60967 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Papss1Q60967 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Papss1Q60967 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Papss1Q60967 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Papss1Q60967 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Papss1Q60967 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Papss1Q60967 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Papss1Q60967 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Papss1Q60967 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Papss1Q60967 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Papss1Q60967 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Papss1Q60967 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Papss1Q60967 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Papss1Q60967 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Papss1Q60967 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Papss1Q60967 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Papss1Q60967 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Papss1Q60967 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Papss1Q60967 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Papss1Q60967 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Papss1Q60967 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms