Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tbc1d1Q60949 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tbc1d1Q60949 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tbc1d1Q60949 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tbc1d1Q60949 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tbc1d1Q60949 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tbc1d1Q60949 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tbc1d1Q60949 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tbc1d1Q60949 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tbc1d1Q60949 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tbc1d1Q60949 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tbc1d1Q60949 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tbc1d1Q60949 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tbc1d1Q60949 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tbc1d1Q60949 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tbc1d1Q60949 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tbc1d1Q60949 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tbc1d1Q60949 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tbc1d1Q60949 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tbc1d1Q60949 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tbc1d1Q60949 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tbc1d1Q60949 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tbc1d1Q60949 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tbc1d1Q60949 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tbc1d1Q60949 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tbc1d1Q60949 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tbc1d1Q60949 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tbc1d1Q60949 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tbc1d1Q60949 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tbc1d1Q60949 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbc1d1Q60949 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbc1d1Q60949 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbc1d1Q60949 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbc1d1Q60949 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbc1d1Q60949 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d1Q60949 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d1Q60949 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d1Q60949 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d1Q60949 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d1Q60949 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d1Q60949 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d1Q60949 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Tbc1d1Q60949 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbc1d1Q60949 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbc1d1Q60949 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbc1d1Q60949 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbc1d1Q60949 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbc1d1Q60949 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tbc1d1Q60949 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tbc1d1Q60949 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbc1d1Q60949 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbc1d1Q60949 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbc1d1Q60949 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbc1d1Q60949 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbc1d1Q60949 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbc1d1Q60949 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbc1d1Q60949 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbc1d1Q60949 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbc1d1Q60949 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbc1d1Q60949 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbc1d1Q60949 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbc1d1Q60949 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbc1d1Q60949 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbc1d1Q60949 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbc1d1Q60949 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbc1d1Q60949 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbc1d1Q60949 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tbc1d1Q60949 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tbc1d1Q60949 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tbc1d1Q60949 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d1Q60949 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d1Q60949 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbc1d1Q60949 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbc1d1Q60949 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbc1d1Q60949 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d1Q60949 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d1Q60949 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d1Q60949 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d1Q60949 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d1Q60949 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d1Q60949 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d1Q60949 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbc1d1Q60949 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbc1d1Q60949 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbc1d1Q60949 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbc1d1Q60949 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbc1d1Q60949 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbc1d1Q60949 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tbc1d1Q60949 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tbc1d1Q60949 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tbc1d1Q60949 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d1Q60949 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d1Q60949 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d1Q60949 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d1Q60949 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d1Q60949 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d1Q60949 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tbc1d1Q60949 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tbc1d1Q60949 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tbc1d1Q60949 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms