Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vdac1Q60932 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vdac1Q60932 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms