Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mkrn3Q60764 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mkrn3Q60764 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mkrn3Q60764 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mkrn3Q60764 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mkrn3Q60764 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mkrn3Q60764 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mkrn3Q60764 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mkrn3Q60764 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mkrn3Q60764 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mkrn3Q60764 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mkrn3Q60764 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mkrn3Q60764 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Mkrn3Q60764 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mkrn3Q60764 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mkrn3Q60764 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mkrn3Q60764 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mkrn3Q60764 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mkrn3Q60764 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mkrn3Q60764 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mkrn3Q60764 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mkrn3Q60764 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mkrn3Q60764 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mkrn3Q60764 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mkrn3Q60764 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mkrn3Q60764 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Mkrn3Q60764 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Mkrn3Q60764 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mkrn3Q60764 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Mkrn3Q60764 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mkrn3Q60764 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mkrn3Q60764 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mkrn3Q60764 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mkrn3Q60764 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mkrn3Q60764 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mkrn3Q60764 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mkrn3Q60764 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mkrn3Q60764 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mkrn3Q60764 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mkrn3Q60764 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mkrn3Q60764 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Mkrn3Q60764 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mkrn3Q60764 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mkrn3Q60764 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mkrn3Q60764 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mkrn3Q60764 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Mkrn3Q60764 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mkrn3Q60764 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Mkrn3Q60764 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mkrn3Q60764 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mkrn3Q60764 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mkrn3Q60764 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mkrn3Q60764 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mkrn3Q60764 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mkrn3Q60764 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mkrn3Q60764 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mkrn3Q60764 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mkrn3Q60764 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mkrn3Q60764 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mkrn3Q60764 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mkrn3Q60764 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Mkrn3Q60764 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mkrn3Q60764 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mkrn3Q60764 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Mkrn3Q60764 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mkrn3Q60764 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mkrn3Q60764 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mkrn3Q60764 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mkrn3Q60764 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mkrn3Q60764 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mkrn3Q60764 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mkrn3Q60764 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mkrn3Q60764 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mkrn3Q60764 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mkrn3Q60764 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mkrn3Q60764 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mkrn3Q60764 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mkrn3Q60764 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mkrn3Q60764 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mkrn3Q60764 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms