Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tcf4Q60722 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tcf4Q60722 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tcf4Q60722 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tcf4Q60722 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tcf4Q60722 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tcf4Q60722 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tcf4Q60722 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tcf4Q60722 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tcf4Q60722 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tcf4Q60722 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tcf4Q60722 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tcf4Q60722 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tcf4Q60722 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tcf4Q60722 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tcf4Q60722 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tcf4Q60722 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tcf4Q60722 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tcf4Q60722 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tcf4Q60722 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tcf4Q60722 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tcf4Q60722 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tcf4Q60722 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tcf4Q60722 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tcf4Q60722 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tcf4Q60722 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tcf4Q60722 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tcf4Q60722 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tcf4Q60722 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tcf4Q60722 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tcf4Q60722 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tcf4Q60722 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tcf4Q60722 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tcf4Q60722 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcf4Q60722 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcf4Q60722 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcf4Q60722 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcf4Q60722 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcf4Q60722 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcf4Q60722 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcf4Q60722 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcf4Q60722 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcf4Q60722 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcf4Q60722 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcf4Q60722 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcf4Q60722 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcf4Q60722 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcf4Q60722 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcf4Q60722 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcf4Q60722 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcf4Q60722 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcf4Q60722 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcf4Q60722 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcf4Q60722 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcf4Q60722 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcf4Q60722 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcf4Q60722 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcf4Q60722 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcf4Q60722 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcf4Q60722 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcf4Q60722 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcf4Q60722 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcf4Q60722 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcf4Q60722 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcf4Q60722 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcf4Q60722 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcf4Q60722 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcf4Q60722 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcf4Q60722 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcf4Q60722 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcf4Q60722 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcf4Q60722 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcf4Q60722 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcf4Q60722 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcf4Q60722 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcf4Q60722 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcf4Q60722 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcf4Q60722 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcf4Q60722 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcf4Q60722 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcf4Q60722 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcf4Q60722 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcf4Q60722 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcf4Q60722 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcf4Q60722 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcf4Q60722 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tcf4Q60722 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tcf4Q60722 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcf4Q60722 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcf4Q60722 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcf4Q60722 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcf4Q60722 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcf4Q60722 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcf4Q60722 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcf4Q60722 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcf4Q60722 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcf4Q60722 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tcf4Q60722 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tcf4Q60722 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tcf4Q60722 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms