Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2f1Q60632 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2f1Q60632 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr2f1Q60632 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr2f1Q60632 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr2f1Q60632 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr2f1Q60632 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2f1Q60632 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2f1Q60632 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2f1Q60632 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2f1Q60632 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2f1Q60632 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2f1Q60632 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nr2f1Q60632 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nr2f1Q60632 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nr2f1Q60632 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nr2f1Q60632 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nr2f1Q60632 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nr2f1Q60632 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nr2f1Q60632 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nr2f1Q60632 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nr2f1Q60632 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nr2f1Q60632 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nr2f1Q60632 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nr2f1Q60632 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nr2f1Q60632 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nr2f1Q60632 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms