Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rnf123Q5XPI3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rnf123Q5XPI3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rnf123Q5XPI3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rnf123Q5XPI3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnf123Q5XPI3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnf123Q5XPI3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnf123Q5XPI3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnf123Q5XPI3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rnf123Q5XPI3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rnf123Q5XPI3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rnf123Q5XPI3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rnf123Q5XPI3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rnf123Q5XPI3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rnf123Q5XPI3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnf123Q5XPI3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnf123Q5XPI3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rnf123Q5XPI3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rnf123Q5XPI3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rnf123Q5XPI3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rnf123Q5XPI3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rnf123Q5XPI3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rnf123Q5XPI3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rnf123Q5XPI3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rnf123Q5XPI3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rnf123Q5XPI3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rnf123Q5XPI3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rnf123Q5XPI3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rnf123Q5XPI3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rnf123Q5XPI3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rnf123Q5XPI3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rnf123Q5XPI3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rnf123Q5XPI3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rnf123Q5XPI3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rnf123Q5XPI3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rnf123Q5XPI3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rnf123Q5XPI3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rnf123Q5XPI3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rnf123Q5XPI3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rnf123Q5XPI3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rnf123Q5XPI3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rnf123Q5XPI3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rnf123Q5XPI3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rnf123Q5XPI3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rnf123Q5XPI3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rnf123Q5XPI3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rnf123Q5XPI3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rnf123Q5XPI3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rnf123Q5XPI3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rnf123Q5XPI3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rnf123Q5XPI3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Rnf123Q5XPI3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnf123Q5XPI3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnf123Q5XPI3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnf123Q5XPI3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnf123Q5XPI3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnf123Q5XPI3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnf123Q5XPI3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rnf123Q5XPI3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rnf123Q5XPI3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rnf123Q5XPI3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rnf123Q5XPI3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rnf123Q5XPI3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnf123Q5XPI3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rnf123Q5XPI3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rnf123Q5XPI3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rnf123Q5XPI3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rnf123Q5XPI3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rnf123Q5XPI3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rnf123Q5XPI3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rnf123Q5XPI3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rnf123Q5XPI3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rnf123Q5XPI3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Rnf123Q5XPI3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rnf123Q5XPI3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rnf123Q5XPI3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Rnf123Q5XPI3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rnf123Q5XPI3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rnf123Q5XPI3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rnf123Q5XPI3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rnf123Q5XPI3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rnf123Q5XPI3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rnf123Q5XPI3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rnf123Q5XPI3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rnf123Q5XPI3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rnf123Q5XPI3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rnf123Q5XPI3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rnf123Q5XPI3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rnf123Q5XPI3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnf123Q5XPI3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnf123Q5XPI3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnf123Q5XPI3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnf123Q5XPI3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rnf123Q5XPI3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rnf123Q5XPI3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rnf123Q5XPI3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rnf123Q5XPI3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rnf123Q5XPI3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rnf123Q5XPI3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnf123Q5XPI3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms