Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf15Q5UBV8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms