Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D9

Thoc6, THO complex subunit 6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc6Q5U4D9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Thoc6Q5U4D9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Thoc6Q5U4D9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Thoc6Q5U4D9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Thoc6Q5U4D9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Thoc6Q5U4D9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Thoc6Q5U4D9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Thoc6Q5U4D9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Thoc6Q5U4D9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Thoc6Q5U4D9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Thoc6Q5U4D9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Thoc6Q5U4D9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Thoc6Q5U4D9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Thoc6Q5U4D9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Thoc6Q5U4D9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Thoc6Q5U4D9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Thoc6Q5U4D9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Thoc6Q5U4D9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Thoc6Q5U4D9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Thoc6Q5U4D9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Thoc6Q5U4D9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Thoc6Q5U4D9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Thoc6Q5U4D9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Thoc6Q5U4D9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Thoc6Q5U4D9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Thoc6Q5U4D9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Thoc6Q5U4D9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Thoc6Q5U4D9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms