Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Scaf1Q5U4C3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Scaf1Q5U4C3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Scaf1Q5U4C3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Scaf1Q5U4C3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC30,51■■■□□ 2,47
Scaf1Q5U4C3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Scaf1Q5U4C3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Scaf1Q5U4C3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Scaf1Q5U4C3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Scaf1Q5U4C3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Scaf1Q5U4C3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Scaf1Q5U4C3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Scaf1Q5U4C3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Scaf1Q5U4C3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Scaf1Q5U4C3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Scaf1Q5U4C3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Scaf1Q5U4C3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC30,45■■■□□ 2,47
Scaf1Q5U4C3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,46
Scaf1Q5U4C3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,46
Scaf1Q5U4C3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,46
Scaf1Q5U4C3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Scaf1Q5U4C3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Scaf1Q5U4C3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC30,44■■■□□ 2,46
Scaf1Q5U4C3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC30,43■■■□□ 2,46
Scaf1Q5U4C3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC30,42■■■□□ 2,46
Scaf1Q5U4C3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Scaf1Q5U4C3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Scaf1Q5U4C3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Scaf1Q5U4C3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,4■■■□□ 2,46
Scaf1Q5U4C3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Scaf1Q5U4C3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,39■■■□□ 2,46
Scaf1Q5U4C3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Scaf1Q5U4C3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Scaf1Q5U4C3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC30,38■■■□□ 2,45
Scaf1Q5U4C3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC30,37■■■□□ 2,45
Scaf1Q5U4C3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Scaf1Q5U4C3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,35■■■□□ 2,45
Scaf1Q5U4C3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC30,34■■■□□ 2,45
Scaf1Q5U4C3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30,34■■■□□ 2,45
Scaf1Q5U4C3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Scaf1Q5U4C3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Scaf1Q5U4C3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Scaf1Q5U4C3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Scaf1Q5U4C3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Scaf1Q5U4C3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Scaf1Q5U4C3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC30,32■■■□□ 2,44
Scaf1Q5U4C3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Scaf1Q5U4C3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,32■■■□□ 2,44
Scaf1Q5U4C3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,31■■■□□ 2,44
Scaf1Q5U4C3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Scaf1Q5U4C3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC30,31■■■□□ 2,44
Scaf1Q5U4C3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Scaf1Q5U4C3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC30,31■■■□□ 2,44
Scaf1Q5U4C3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC30,31■■■□□ 2,44
Scaf1Q5U4C3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30,3■■■□□ 2,44
Scaf1Q5U4C3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Scaf1Q5U4C3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Scaf1Q5U4C3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,27■■■□□ 2,44
Scaf1Q5U4C3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,27■■■□□ 2,44
Scaf1Q5U4C3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Scaf1Q5U4C3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30,26■■■□□ 2,44
Scaf1Q5U4C3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC30,26■■■□□ 2,44
Scaf1Q5U4C3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,44
Scaf1Q5U4C3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,44
Scaf1Q5U4C3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC30,26■■■□□ 2,43
Scaf1Q5U4C3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC30,26■■■□□ 2,43
Scaf1Q5U4C3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC30,26■■■□□ 2,43
Scaf1Q5U4C3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Scaf1Q5U4C3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Scaf1Q5U4C3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Scaf1Q5U4C3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Scaf1Q5U4C3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Scaf1Q5U4C3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Scaf1Q5U4C3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Scaf1Q5U4C3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Scaf1Q5U4C3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC30,2■■■□□ 2,43
Scaf1Q5U4C3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Scaf1Q5U4C3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Scaf1Q5U4C3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,19■■■□□ 2,42
Scaf1Q5U4C3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Scaf1Q5U4C3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30,18■■■□□ 2,42
Scaf1Q5U4C3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Scaf1Q5U4C3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,18■■■□□ 2,42
Scaf1Q5U4C3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Scaf1Q5U4C3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Scaf1Q5U4C3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Scaf1Q5U4C3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Scaf1Q5U4C3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC30,17■■■□□ 2,42
Scaf1Q5U4C3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Scaf1Q5U4C3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Scaf1Q5U4C3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Scaf1Q5U4C3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Scaf1Q5U4C3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Scaf1Q5U4C3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Scaf1Q5U4C3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Scaf1Q5U4C3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Scaf1Q5U4C3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Scaf1Q5U4C3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,41
Scaf1Q5U4C3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Scaf1Q5U4C3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms