Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Specc1Q5SXY1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Specc1Q5SXY1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Specc1Q5SXY1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Specc1Q5SXY1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Specc1Q5SXY1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Specc1Q5SXY1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Specc1Q5SXY1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Specc1Q5SXY1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Specc1Q5SXY1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Specc1Q5SXY1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Specc1Q5SXY1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Specc1Q5SXY1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Specc1Q5SXY1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Specc1Q5SXY1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Specc1Q5SXY1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Specc1Q5SXY1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Specc1Q5SXY1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Specc1Q5SXY1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Specc1Q5SXY1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Specc1Q5SXY1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Specc1Q5SXY1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Specc1Q5SXY1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Specc1Q5SXY1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Specc1Q5SXY1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Specc1Q5SXY1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Specc1Q5SXY1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Specc1Q5SXY1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Specc1Q5SXY1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Specc1Q5SXY1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Specc1Q5SXY1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Specc1Q5SXY1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Specc1Q5SXY1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Specc1Q5SXY1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Specc1Q5SXY1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Specc1Q5SXY1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Specc1Q5SXY1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Specc1Q5SXY1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Specc1Q5SXY1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Specc1Q5SXY1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Specc1Q5SXY1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Specc1Q5SXY1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Specc1Q5SXY1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Specc1Q5SXY1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Specc1Q5SXY1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Specc1Q5SXY1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Specc1Q5SXY1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Specc1Q5SXY1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Specc1Q5SXY1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Specc1Q5SXY1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Specc1Q5SXY1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Specc1Q5SXY1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Specc1Q5SXY1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Specc1Q5SXY1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Specc1Q5SXY1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Specc1Q5SXY1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Specc1Q5SXY1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Specc1Q5SXY1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Specc1Q5SXY1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Specc1Q5SXY1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Specc1Q5SXY1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Specc1Q5SXY1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Specc1Q5SXY1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Specc1Q5SXY1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Specc1Q5SXY1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Specc1Q5SXY1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Specc1Q5SXY1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Specc1Q5SXY1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Specc1Q5SXY1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Specc1Q5SXY1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Specc1Q5SXY1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Specc1Q5SXY1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Specc1Q5SXY1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Specc1Q5SXY1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Specc1Q5SXY1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Specc1Q5SXY1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Specc1Q5SXY1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Specc1Q5SXY1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Specc1Q5SXY1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Specc1Q5SXY1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Specc1Q5SXY1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Specc1Q5SXY1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Specc1Q5SXY1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Specc1Q5SXY1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Specc1Q5SXY1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Specc1Q5SXY1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Specc1Q5SXY1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Specc1Q5SXY1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Specc1Q5SXY1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Specc1Q5SXY1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Specc1Q5SXY1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Specc1Q5SXY1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Specc1Q5SXY1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Specc1Q5SXY1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Specc1Q5SXY1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Specc1Q5SXY1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Specc1Q5SXY1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Specc1Q5SXY1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Specc1Q5SXY1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Specc1Q5SXY1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms